Protopet.
Protopet oli Megacorpin keksintö, joka oli geneettisesti muunneltu täydellisen lemmikin prototyyppi. Se oli alunperin pieni, hellyyttävä pörröinen sinikarvainen olento, jolla oli kaksi isoa silmää, neljä pientä jalkaa, ja yksi tuntosarvi. Ennen sen oikean nimen tietämistä Ratchet, Clank ja Angela Cross kutsuivat sitä kokeeksi.
Kun protopet julkaistiin, se oli jäänyt vialliseksi ja tarkastamattomaksi kapteeni Qwarkin takia, joka suunnitteli päästävänsä protopetit valloilleen ja sen jälkeen itse pelastavansa galaksi niistä.
Protopet on pelin Going Commando viimeinen ja suurin bossi.
Kerran Gadgetron yritti luoda protopetin tapaista geneettisesti muunneltua lemmikkiä, mutta kuten protopet, myös heidän luomuksensa epäonnistui siitä tullen aggressiivinen ja vaarallinen.
Going Commando[]
Abercrombie Fizzwidget palkkasi Ratchetin hakemaan takaisin Protopet, jonka Varas oli varastanut. Ratchet ja Clank tekivätkin näin, tajuamatta, että Varas oli varastanut protopetin kaikkien turvallisuuden takia. Kaksikko kävi tämän kanssa monet kamppailut protopetistä ja saivat palautettua sen Fizzwidgetille, ennen kuin Varas paljastui Angela Crossiksi. Tämä selitti kaksikolle, että protopet on viallinen ja se ei saa päätyä julkaistuksi.
Pian Megacorpin työntekijät alkoivat julkaisemaan tiedotuksia protopetin vaarallisuudesta. Se saattoi nimittäin syödä omistajansakin, ei väliä oliko tämä robotti vai orgaaninen elämämuoto. Protopetit kuitenkin ehtivät päästä myydyiksi, ja ne kloonaantuivat todella nopeasti, sillä alkuperäistä Protopetia ei saatu tuhottua. Protopetit kloonaantuivat sylkemällä suustaan kolme pientä protopetia. Monet kokonaiset planeetat, kuten Grelbin ja Damosel, joutuivat monien tuhansien Protopetien vaaran kohteiksi.
Fizzwidget ja alkuperäinen Protopet
Pelin lopussa Qwark vahingossa muuntaa Angela Crossin suunnittelemalla Helix-O-Morphilla Protopetin jättimäismäiseksi, jonka Ratchet ja Clank saavat onneksi tuhottua ja protopetien synty loppuu. Paljastui, että Qwark oli laittanut laitteen patterit väärin, jonka takia se ei ollut toiminut oikein.
Up Your Arsenal[]
Tässä pelissä Qwark väitti pelastaneensa Bogon-galaksin protopetien hyökkäykseltä. Alkuperäinen protopet nähdään myös sen luojan Abercrombie Fizzwidgetin kanssa katsomassa uusinta osaa Secret Agent Clankista.