Piraattikallot ovat irrotettuja epäkuolleiden piraattien päitä. Tapettuaan epäkuolleen piraatin, Ratchet voi Omnijakoavain Millennium 12:lla poimia ja heittää piraattikalloja.
Heittämällä kalloja voi vahingoittaa kapteeni Darkwaterin haamua. Niillä voi myös tuhota epäkuolleita voimakenttiä, jollaista käytettiin Talwyn Apogeen vangitsemiseen.